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Characterization of the variable region in the class 1 integron of antimicrobial-resistant Escherichia coli isolated from surface water BJM
Canal,Natália; Meneghetti,Karine Lena; Almeida,Clara Ponzi de; Bastos,Marina da Rosa; Otton,Letícia Muner; Corção,Gertrudes.
Abstract Fecal bacteria are considered to be a potential reservoir of antimicrobial resistance genes in the aquatic environment and could horizontally transfer these genes to autochthonous bacteria when carried on transferable and/or mobile genetic elements. Such circulation of resistance genes constitutes a latent public health hazard. The aim of this study was to characterize the variable region of the class 1 integron and relate its genetic content to resistance patterns observed in antimicrobial-resistant Escherichia coli isolated from the surface waters of Patos Lagoon, Southern Brazil. Genetic diversity of the isolates and presence of the qacEΔ1 gene, which confers resistance to quaternary ammonium compounds, were also investigated. A total of 27...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Antibiotic resistance; Class 1 integron; Superficial water; Escherichia coli.
Ano: 2016 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822016000200337
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Clinical aspects of experimental peritonitis in horses Ciência Rural
Mendes,Luiz Cláudio Nogueira; Marques,Luiz Carlos; Iturrino,Ruben Pablo Schocken; Ávila,Fernando Antônio de.
Sixteen adult horses were randomly divided into 4 equal groups (GI, GII, GIII and GIV) of 4 animals and each group was injected intraperitoneally with one of the following suspension: GI (100 x 10(7) colony-forming units (CFU) of Escherichia coli diluted in 500ml of 0.9% saline); GII (100 x 10(7) CFU of Bacteroides fragilis in 500ml of 0.9% saline); GIII (100 x 10(7) CFU of E. coli in combination with 100 x 10(7) CFU of B. fragilis in 500ml of 0.9% saline); GIV (500ml of 0.9% saline). Abdominal wall sensitivity to external pressure and tension, diarrhea, decreased intestinal sounds and increased of heart rate were the clinical signs more frequently observed in inoculated horses. Horses inoculated with pure cultures of either E. coli or B. fragilis...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Peritonitis; Horses; Escherichia coli; Bacteroides fragilis.
Ano: 1999 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84781999000300019
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Clonagem e purificação de fragmento da proteína capsidial de Banana streak OL virus PAB
Lombardi,Ricardo; Harakava,Ricardo; Colariccio,Addolorata.
O objetivo deste trabalho foi clonar e induzir a expressão de fragmento da proteína capsidial de Banana streak OL virus (BSOLV-CP) em Escherichia coli, bem como purificar a proteína recombinante obtida. Empregou-se um par de iniciadores específicos para amplificar, em PCR, um fragmento de aproximadamente 390 pb, da região codificadora da porção central da BSOLV-CP. O fragmento obtido foi clonado em vetor pGEM-T Easy, subclonado em vetor pQE-30 e transformado em células de E. coli M15 (pREP4) por choque térmico. A expressão da proteína foi induzida por tiogalactopiranosídeo de isopropila (IPTG), e a proteína recombinante BSOLV-rcCP de 14 kDa foi detectada em Western blot e Dot blot. A expressão da proteína BSOLV-rcCP abre novas possibilidades para a...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Badnavirus; Escherichia coli; Musa; Antissoro; Bananeira; Expressão de proteínas recombinantes.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2010000800006
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Colibacillosis in lambs is associated to type I heat-stable enterotoxin in a farm in São Paulo State, Brazil Ciência Rural
Aragão,Annelize Zambon Barbosa; Teocchi,Marcelo Ananias; Fregolente,Maria Clara Duarte; Gatti,Maria Silvia Viccari; Pires,Alexandre Vaz; Yano,Tomomasa.
Twenty seven (48.2%) culture supernatants of 56 Escherichia coli isolated from diarrheic lamb feces (7 to 10 days old) in São Paulo State, Brazil, presented positive results to suckling mice assay (fluid accumulation) but none caused cytopathic effects on Vero and CHO cells, indicating that these strains did not produced LT or VT toxins. PCR assays showed that these 27 E. coli strains harbored estA, that codifies for STa, but not for stx1, stx2 or cnf genes. The positive STa strains were checked for genes that codify for F41, F17 and K99 fimbriae, wich are considered colonization factors in ETEC. Only F17 was detect in two samples (7.4%). Twelve of 27 STa positive carried hlyA gene and presented hemolytic activity in blood Agar. Presence of rotavirus was...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/report Palavras-chave: Lambs; STa; Colibacillosis; Escherichia coli.
Ano: 2012 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782012000500015
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Colimetria de água marinha em áreas de cultivo e extrativismo de mexilhões no município de Niterói, RJ Arq. Bras. Med. Vet. Zootec.
Pinheiro Jr.,A.A.; Oliveira,L.A.T.; Franco,R.M.; Carvalho,J.C.A.P..
Analisaram-se amostras de água do mar de cinco pontos da Baía de Guanabara quanto ao número mais provável (NMP) de coliformes totais e de Escherichia coli usando-se o método fluorogênico, e verificaram-se o pH, a salinidade e a temperatura dos locais de colheita. As contagens de E. coli nas amostras das estações Icaraí, Boa Viagem e Santa Cruz foram, em média, acima do previsto na legislação, enquanto que nas estações Piratininga e Rio Branco, 92,9% e 100% das amostras tiveram contagens de E. coli menor que 3/100ml. Observou-se relação positiva entre coliformes totais e E. coli, enquanto que a correlação entre colimetria, pH, salinidade e temperatura da água não foi significativa. Temperatura e pH mostraram pouca variação entre as estações, sendo as médias...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Coliformes; Escherichia coli; Águas de cultivo; Baía de Guanabara.
Ano: 2002 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352002000400016
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Comparaison de methodes directes (microscopiques) et indirectes (par mise en culture) dans l'evaluation d'une pollution bacterienne d'origine fecale. Etude preliminaire ArchiMer
Munro, P; Bianchi, M.
Cells of two serotypes of Escherichia coli (O26B6 and 0111B4) were counted using epifluorescence and immunofluorescence microscopy (nonavalent serum) and plate count on specific medium. Values from indirect counts were 10 fold smaller than those from both microscopic counts. In a sample of sea water from an area receiving a fecal pollution, the highest number of bacteria was obtained by epifluorescence microscopy. In that case, the number of cells counted by immunofluorescence microscopy was 10 fold smaller than the number of bacteria able to grow on the medium. It could be due to: the diversity of the natural community, the possibility to other bacteria than E. coli to grow on the used culture medium, the restrictiveness of the serum for "pathogenic...
Tipo: Text Palavras-chave: Escherichia coli; Bacteria; Microbiological culture; Pathogenic bacteria; Microbial contamination; Bacterial counters; Fluorescence microscopy; Bacteria collecting devices; Indicator species.
Ano: 1984 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/1984/acte-1001.pdf
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Comparison of base substitutions in response to nitrogen ion implantation and 60Co-gamma ray irradiation in Escherichia coli Genet. Mol. Biol.
Chuan-Xiao,Xie; An,Xu; Li-Jun,Wu; Jian-Min,Yao; Jian-Bo,Yang; Zeng-Liang,Yu.
To identify the specificity of base substitutions, a novel experimental system was established based on rifampicin-resistant (Rif r) mutant screening and sequencing of the defined region of the rpoB gene in E. coli. We focused on comparing mutational spectra of base substitutions induced by either low energy nitrogen ion beam implantation or 60Co-gamma rays. The most significant difference in the frequency of specific kinds of mutations induced by low energy nitrogen ion beam was that CG <FONT FACE=Symbol>®</font>TA transitions were significantly increased from 32 to 46, AT <FONT FACE=Symbol>®</font>TA transversions were doubled from 7 to 15 in 50 mutants, respectively. The preferential base substitutions induced by nitrogen ion...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Base substitution; Low-energy nitrogen ion beam implantation; 60Co-gamma rays; Escherichia coli.
Ano: 2004 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572004000200025
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Contrasting effects of historical contingency on phenotypic and genomic trajectories during a two-step evolution experiment with bacteria ArchiMer
Plucain, Jessica; Suau, Antonia; Cruveiller, Stephane; Medigue, Claudine; Schneider, Dominique; Le Gac, Mickael.
Background The impact of historical contingency, i.e. the past evolutionary history of a population, on further adaptation is mostly unknown at both the phenotypic and genomic levels. We addressed this question using a two-step evolution experiment. First, replicate populations of Escherichia coli were propagated in four different environmental conditions for 1000 generations. Then, all replicate populations were transferred and propagated for further 1000 generations to a single new environment. Results Using this two-step experimental evolution strategy, we investigated, at both the phenotypic and genomic levels, whether and how adaptation in the initial historical environments impacted evolutionary trajectories in a new environment. We showed that...
Tipo: Text Palavras-chave: Experimental evolution; Escherichia coli; Adaptation; Historical contingency; Epistasis.
Ano: 2016 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00333/44447/44118.pdf
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CTX-M extended-spectrum β-lactamase-producing Klebsiella spp, Salmonella spp, Shigella spp and Escherichia coli isolates in Iranian hospitals BJM
Bialvaei,Abed Zahedi; Kafil,Hossein Samadi; Asgharzadeh,Mohammad; Aghazadeh,Mohammad; Yousefi,Mehdi.
Abstract This study was conducted in Iran in order to assess the distribution of CTX-M type ESBLs producing Enterobacteriaceae. From January 2012 to December 2013, totally 198 E. coli, 139 Klebsiella spp, 54 Salmonella spp and 52 Shigella spp from seven hospitals of six provinces in Iran were screened for resistance to extended-spectrum cephalosporins. After identification and susceptibility testing, isolates presenting multiple-drug resistance (MDR) were evaluated for ESBL production by the disk combination method and by Etest using (cefotaxime and cefotaxime plus clavulanic acid). All isolates were also screened for bla CTX-M using conventional PCR. A total of 42.92%, 33.81%, 14.81% and 7.69% of the E. coli, Klebsiella spp, Salmonella spp and Shigella...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Klebsiella spp; Salmonella spp; Shigella spp; Escherichia coli; Multi-drug resistant; ESBL; CTX-M.
Ano: 2016 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822016000300706
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Curli fimbria: an Escherichia coli adhesin associated with human cystitis BJM
Cordeiro,Melina Aparecida; Werle,Catierine Hirsch; Milanez,Guilherme Paier; Yano,Tomomasa.
Abstract Escherichia coli is the major causative agent of human cystitis. In this study, a preliminary molecular analysis carried out by PCR (polymerase chain reaction) demonstrated that 100% of 31 E. coli strains isolated from patients with recurrent UTIs (urinary tract infections) showed the presence of the curli fimbria gene (csgA). Curli fimbria is known to be associated with bacterial biofilm formation but not with the adhesion of human cystitis-associated E. coli. Therefore, this work aimed to study how curli fimbria is associated with uropathogenic E. coli (UPEC) as an adhesion factor. For this purpose, the csgA gene was deleted from strain UPEC-4, which carries three adhesion factor genes (csgA, fimH and ompA). The wild-type UPEC-4 strain and its...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Curli fimbria; Adhesion; Escherichia coli; UPEC.
Ano: 2016 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822016000200414
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Dénombrement des Escherichia coli dans des sédiments de la baie de l'Aiguillon ArchiMer
Derrien, Annick.
Le rôle des sédiments dans la contamination du milieu marin en baie de l'Aiguillon est une des problématiques du laboratoire. Pendant quinze mois des dénombrements d'Escherichia coli dans des sédiments de la baie ont été effectués. Deux méthodes de numération ont été comparées: la technique NPP en tubes et la technique NPP en microplaque. En période printemps-été, la méthode NPP miniaturisée a conduit à des résultats sensiblement supérieurs à ceux obtenus par la méthode NPP en tubes. Cette différence pourrait s'expliquer par une fluorescence parasite du sédiment pendant cette période (éventuellement par du plancton; hypothèse non confirmée). Les concentrations en E.coli des sédiments sont variables au cours de l'année avec un niveau de contamination faible...
Tipo: Text Palavras-chave: Sédiments; Escherichia coli; Dénombrement.
Ano: 2004 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00107/21811/19386.pdf
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Depuration Times of Donax trunculus and Tapes decussatus BJM
Çolakolu,Fatma Arik; Çardak,Mine; Çolakoglu,Serhat; Künili,Ibrahim Ender.
The present study was performed to determine the depuration time and ability of Donax trunculus (Wedge Clam) and Tapes decussatus (Carpet Shell) contaminated with Escherichia coli, Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium and Vibrio parahaemolyticus. Clams were contaminated with each bacterium at the level of 7.0 - 8.0 Log10 cfu/g. After contamination, clams were analyzed every 3 h in the first 24 h time period and every 6 h until the 72nd hour. During the depuration process of both clams, the level of bacteria decreased quickly to 40% of initial load in the first 12 h. The results of this study indicate that the depuration time of carpet shells for all bacteria is 66 h. The depuration process of the wedge clam was different from the carpet...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Clam; Purification; Vibrio parahaemolyticus; Escherichia coli; Salmonella typhimurium.
Ano: 2014 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822014000300034
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Design and expression of a retro doublet of cecropin with enhanced activity Electron. J. Biotechnol.
Díaz,Mauricio; Arenas,Gloria; Marshall,Sergio H.
Novel doublet molecules of cecropin A from Drosophila melanogaster were designed and constructed combining the regular (CECdir) with the inverted (CECret) coding sequence of the standard CEC A1 gene resulting in the following configurations: CECdir-CECret and CECret-CECdir. These two recombinant molecules were generated using a three-primer driven PCR reaction yielding composite single functional aminoacidic molecules with the coding sequences of CECdir linked in frame with the coding sequence of CECret and vice versa. In order to obtain these constructions, a retropeptide DNA-coding sequence was chemically synthesized to match the expected polarity of the newly generated CECret sequence. Both doublet antimicrobial peptides (drAMPs) were cloned in the T7...
Tipo: Journal article Palavras-chave: Antimicrobial peptides; Escherichia coli; Expression.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0717-34582008000200006
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Detecção de cepas patogênicas pela PCR multiplex e avaliação da sensibilidade a antimicrobianos de Escherichia coli isoladas de leitões diarréicos Arq. Bras. Med. Vet. Zootec.
Macêdo,N.R.; Menezes,C.P.L.; Lage,A.P.; Ristow,L.E.; Reis,A.; Guedes,R.M.C..
Avaliou-se a freqüência dos genes de fímbrias (K88, K99, 987P, F18 e F41) e toxinas (LT, Stb, StaP e Stx2e) de cepas de E. coli isoladas de leitões com diarréia usando a técnica de PCR multiplex com primers específicos para esses genes, e estudou-se o padrão de sensibilidade das cepas patogênicas pelo método de difusão em disco ao florfenicol, ceftiofur sódico, colistina, fosfomicina, neomicina, norfloxacina, sulfa + trimetoprim, doxiciclina, tetraciclina e lincomicina. Foram utilizadas 144 amostras de E.coli isoladas de leitões com diarréia, provenientes de granjas localizadas no estado de Minas Gerais. Dessas, 42 (29,2%) foram positivas para pelo menos um dos fatores de virulência testados. Dentre essas 42 amostras, 23 (54,8%) apresentaram genes de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Suíno; Escherichia coli; Tipificação; PCR multiplex; Sensibilidade antimicrobiana.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352007000500005
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Detección del crecimiento de Escherichia Coli con termografía infrarroja Agrociencia
Hernández-Eugenio,Guadalupe; Echeverría-Landín,Eliubi; Hahn Schlam,Federico.
Resumen: La determinación de contaminación microbiológica debe ser rápida y se debiera medir in-situ. En el presente trabajo se desarrolló una metodología rápida y portátil para la detección de Escherichia coli, basada en el análisis de imágenes térmicas de infrarrojo. Cultivos de E. coli en medio clásico agar LEVINE fueron fotografiados en imágenes térmicas, obtenidas mediante una cámara infrarroja (IR). Dos prototipos fueron acoplados a la cámara IR con la finalidad de mantener una temperatura constante (37 °C) de las muestras. El primero de ellos radiaba calor en la base de las muestras mientras el segundo calentaba la muestra radialmente. La cinética de crecimiento fue seguida con imágenes térmicas, encontrando que el tiempo mínimo de detección de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Escherichia coli; Cámara infrarroja; Emisividad; Radiómetro.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1405-31952007000500503
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Detection of integrons among multi-drug resistant (MDR) Escherichia coli strains isolated from clinical specimens in northern west of Iran BJM
Rezaee,Mohammad Ahangarzadeh; Sheikhalizadeh,Vajihe; Hasani,Alka.
Transference of resistance determinants by integrons is one of the important factors that can contribute to the increase in multi-resistant bacteria. We determined the prevalence and class of integrons among multi-drug resistant (MDR) Escherichia coli strains isolated from clinical specimens in Tabriz teaching hospitals. Firstly, susceptibility of 140 isolates to 13 antibiotics was determined using the disc diffusion method. Then, prevalence and class of integrons was detected in MDR strains by PCR-RFLP. One hundred five (75%) of total 140 isolates were uropathogenic Escherichia coli (UPEC). Other pathotypes included were: diarrheagenic Escherichia coli (13; 9.3%), sepsis-associated E. coli (5; 3.6%) and newborn meningitis-associated E. coli (2; 1.4%)....
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Integron; Escherichia coli; Multi-drug resistance.
Ano: 2011 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822011000400010
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Detection of virulence genes and the phylogenetic groups of Escherichia coli isolated from dogs in Brazil Ciência Rural
Coura,Fernanda Morcatti; Diniz,Amanda Nadia; Oliveira Junior,Carlos Augusto; Lage,Andrey Pereira; Lobato,Francisco Carlos Faria; Heinemann,Marcos Bryan; Silva,Rodrigo Otávio Silveira.
ABSTRACT: This study identified the virulence genes, pathovars, and phylogenetic groups of Escherichia coli strains obtained from the feces of dogs with and without diarrhea. Virulence genes and phylogenetic group identification were studied using polymerase chain reaction. Thirty-seven E. coli isolates were positive for at least one virulence factor gene. Twenty-one (57.8%) of the positive isolates were isolated from diarrheal feces and sixteen (43.2%) were from the feces of non-diarrheic dogs. Enteropathogenic E. coli (EPEC) were the most frequently (62.2%) detected pathovar in dog feces and were mainly from phylogroup B1 and E. Necrotoxigenic E. coli were detected in 16.2% of the virulence-positive isolates and these contained the cytotoxic necrotizing...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Dogs; Escherichia coli; Pathovars; Phylogroups.
Ano: 2018 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782018000200452
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DIARRÉIA NEONATAL DE ORIGEM BACTERIANA EM BOVINOS Ciência Rural
Pianta,Celso.
Diarréia neonatal em bovinos é um quadro complexo, normalmente responsável por altas taxas de morbidade e mortalidade. Os prejuízos são observados não somente nos gastos com a medicação, mas também na perda do animal em caso de morte e na redução do desenvolvimento e do desempenho do futuro animal adulto, comprometendo os índices de ganho de peso ou produção leiteira. A etiologia múltipla da enfermidade envolve a interação de diversas variáveis dos agentes, hospedeiro e meio ambiente. Nesta revisão são abordados os aspectos clínicos da colibacilose sanitário, a prevenção e o tratamento são também abordados.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Diarréia neonatal; Escherichia coli; Bezerros.
Ano: 1993 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84781993000100021
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Diarrheagenic Escherichia coli BJM
Gomes,Tânia A.T.; Elias,Waldir P.; Scaletsky,Isabel C.A.; Guth,Beatriz E.C.; Rodrigues,Juliana F.; Piazza,Roxane M.F.; Ferreira,Luís C.S.; Martinez,Marina B..
ABSTRACT Most Escherichia coli strains live harmlessly in the intestines and rarely cause disease in healthy individuals. Nonetheless, a number of pathogenic strains can cause diarrhea or extraintestinal diseases both in healthy and immunocompromised individuals. Diarrheal illnesses are a severe public health problem and a major cause of morbidity and mortality in infants and young children, especially in developing countries. E. coli strains that cause diarrhea have evolved by acquiring, through horizontal gene transfer, a particular set of characteristics that have successfully persisted in the host. According to the group of virulence determinants acquired, specific combinations were formed determining the currently known E. coli pathotypes, which are...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Escherichia coli; Diarrhea; Pathogenic mechanisms; Virulence factor; Epidemiology.
Ano: 2016 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822016000500003
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Diferentes vias de administração de probiótico sobre o desempenho, o rendimento de carcaça e a população microbiana do intestino delgado de codornas de corte R. Bras. Zootec.
Otutumi,Luciana Kazue; Furlan,Antonio Claudio; Martins,Elias Nunes; Nakamura,Celso Vataru; Garcia,Elis Regina de Moraes; Loose,Priscila Ventura.
Objetivou-se avaliar duas vias de administração de probiótico sobre o desempenho, o rendimento de carcaça e a população microbiana do intestino delgado de codornas de corte. Foram utilizadas 1.050 codornas machos e fêmeas de 1 dia de idade distribuídas em delineamento inteiramente casualizado com três tratamentos (controle, probiótico na água bebida e probiótico na ração) e cinco repetições de 70 aves. A cada sete dias, foram avaliados o ganho de peso, o consumo de ração, a conversão alimentar e a viabilidade criatória. Aos 7 e aos 14 dias, 15 aves foram abatidas para determinação da contagem de Lactobacillus sp., enterobactérias e Escherichia coli do intestino delgado e, aos 35 dias, 30 aves foram abatidas para avaliação do rendimento de carcaça e de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Conversão alimentar; Escherichia coli; Lactobacilos.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982010000100021
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